Что такое молекулярно биологическое исследование
Молекулярно-биологические исследования
Молекулярно-биологические исследования проводятся с применением метода ПЦР.
ПЦР-диагностика особенно эффективна при выявлении трудно культивируемых (уреаплазмы, микобактерии и др.) и некультивируемых (вирусы, хламидии и др.) форм микроорганизмов, с которыми часто приходится сталкиваться при скрытых и хронических инфекциях.
Исходный материал для ПЦР может быть получен из любой ткани или жидкости.
Для проведения ПЦР-исследования требуется 4-4,5 часа.
В НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова отдел ПЦР-диагностики расположен на базе бактериологической лаборатории отделения лабораторной диагностики, что позволяет объединить усилия и сократить сроки идентификации возбудителя инфекционного процесса, что имеет огромное значение в клинической практике.
Цены на некоторые основные виды исследований:
Комплекс молекулярно-биологического исследования на ИППП
Молекулярно-биологическое исследование на ВПЧ высокого канцерогенного риска (скрининг)
Молекулярно-биологическое исследование на ВПЧ высокого канцерогенного риска, генотип (количественный)
можно найти в прайс-листе, воспользовавшись быстрым поиском
Молекулярно-биологические исследования
Проведение полимеразной цепной реакции «в реальном времени» (Real Time PCR) является наиболее качественным и быстрым методом исследования. Метод ПЦР универсален – одна порция биологического материала позволяет провести исследования на наличие возбудителей целого ряда заболеваний.
Почему ПЦР диагностика обладает такой ценностью?
Одним из существенных преимуществ метода ПЦР является высокая чувствительность – от 95 до 100%.
ПЦР в диагностике инфекций
Преимущества метода ПЦР (чувствительность и специфичность) определяют широкий спектр применения в современной медицине. Метод ПЦР автоматизирован и позволяет получить результаты анализа в течение одного рабочего дня. ПЦР используется в акушерстве, гинекологии, неонатологии, педиатрии, урологии, венерологии, нефрологии, клинике инфекционных болезней, офтальмологии, неврологии, фтизиопульмонологии и др.
Метод ПЦР позволяет проводить диагностику многих инфекционных заболеваний со сложной серологической картиной, определять «вирусную нагрузку» в крови пациента, выявлять дисбиоз урогенитального тракта у женщин и мужчин.
Половым путем могут передаваться бактериальные (гонорея, хламидиоз, уреаплазмоз, микоплазмоз, гарднереллез), вирусные (герпес, цитомегаловирус, гепатит), протозойные (трихомониаз) и грибковые (кандидоз) инфекции.
Для быстрой, полной и недорогой диагностики инфекций, передаваемых половым путем, был разработан комплексный ПЦР анализ на 6, 10 и 11 основных возбудителей.
График выдачи результатов молекулярно-биологических и цитогенетических исследовании
ПЦР исследования на 2-4 рабочий день
Тромбозы+ фолаты (код 73038), гипертоническая болезнь (код 73044), ожирение (код 74044Б) – 7 рабочих дней
Интерлейкин (код 73045)– выдача результатов каждый четверг
Метаболизм кальция (код 7061) – 4 рабочих дня
Цитогенетические исследования выполняются в течение 14-18 рабочих дней
Молекулярная диагностика рака
Молекулярно-генетическое тестирование является неотъемлемой частью обследования и лечения онкологических больных во всем мире.
Анализ опухоли каждого конкретного пациента и формирование индивидуального перечня потенциальных молекул-мишеней стало возможным благодаря внедрению методик молекулярно-генетического анализа в клиническую практику. Научная лаборатория молекулярной онкологии НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова выполняет полный спектр современных молекулярно-генетических исследований для онкологических пациентов и их родственников.
Кому и чем могут помочь генетические исследования?
НМИЦ онкологии им. Н.Н. Петрова осуществляет полный комплекс мероприятий, связанных с диагностикой наследственной предрасположенности к раку молочной железы.
Любой человек является носителем каких-то мутаций, опасных либо для нас, либо для потомства. Первое направление исследований онкогенетиков – выявление наследственных мутаций с помощью секвенирования генома. Второе направление – исследование собственно опухоли, спектра приобретенных клеткой мутаций, в связи с которыми она возникла. Для этого тоже требуется исследование генома всего организма, чтобы сравнить последовательность ДНК опухоли с последовательностью ДНК в организме. Поэтому в будущем оно потребуется для лечения любой опухоли.
Подробнее узнать о деятельности Лаборатории молекулярной онкологии здесь.
Подробнее узнать о Группе молекулярно-генетических методов исследований референс-центра по ссылке.
Молекулярно-биологические исследования
На сегодняшний день молекулярно-генетические маркеры рутинно используются в клинической практике на всех этапах оказания онкологической помощи – в профилактике, ранней и дифференциальной диагностике, а также лечении пациентов, страдающих злокачественными новообразованиями.
Наиболее значимыми представляются два направления клинико-прикладных исследований — диагностика наследственных раковых синдромов и индивидуальный подбор лекарственных препаратов на основе молекулярных характеристик опухоли.
Наследственные опухолевые синдромы
Наследственные опухолевые синдромы – группа заболеваний, проявление которых заключается в передаче из поколения в поколение практически фатальной предрасположенности к тому или иному виду рака. Они составляют незначительную пропорцию от общего числа новообразований (около 1%), хотя для отдельных локализаций (молочная железа, яичник, толстая кишка), их удельный вклад достигает более высоких показателей (5-20%).
Причиной подобных заболеваний является носительство наследуемой «раковой» мутации. Лица, имеющие такое генетическое повреждение, до определенного момента остаются практически здоровыми, однако они обладают фатально увеличенным риском возникновения неоплазм – пенетрантность соответствующих мутаций обычно составляет 85-100%.
Подавляющее большинство известных онкогенов, вовлеченных в патогенез наследственных опухолевых синдромов, составляют т.н. супрессорные гены. Эти генетические элементы в норме осуществляют негативный контроль клеточного деления, регулируют процессы репарации ДНК, запускают механизмы программируемой клеточной гибели и т.д.
Если происходит их инактивация, то соответствующий клон приобретает новые качества (ускоренная пролиферация, иммортализация, патологическое накопление мутаций и т.д.). Подобные события ускоряют приобретение новых критических генетических нарушений – возникает цепная реакция, в конечном счете, приводящая к образованию опухоли.
Виды наследственных опухолевых синдромов
Синдром | Гены | Основные онкологическиепроявления синдрома |
---|---|---|
Наследственный рак молочной железы и/или яичников | BRCA1 BRCA2 | Рак молочной железы, рак яичников, рак предстательной железы, рак желудка, рак поджелудочной железы, рак органов головы и шеи |
Наследственный ракмолочной железы | CHEK2 NBS BLM | Рак молочной железы |
Наследственный неполипозный рак толстой кишки (синдром Lynch, HPNCC) | MLH1 MSH2 MSH6 PMS2 | Рак толстой кишки, рак эндометрия; реже – опухоли желудка, тонкой кишки, яичников, мозга, желче- и мочевыводящих путей |
Семейный аденоматозный полипоз толстой кишки | APC | Множественные аденоматозные полипы толстой кишки, опухоли толстой кишки |
Наследственный диффузный рак желудка | CDH1 | Диффузный рак желудка |
Наследственный рак щитовидной желез | RET | Медуллярные опухоли щитовидной железы |
Синдром Li-Fraumeni | TP53 | Опухоли различных типов (саркомы, опухоли молочной железы, опухоли мозга, лейкозы и т.д.) |
Наследственная меланома | CDKN2A CDK4 | Диспластические невусы и меланома |
Синдром Von Hippel-Lindau | VHL | Опухоли почек, надпочечников, поджелудочной железы |
Наследственная ретинобластома | RB1 | Ретинобластомы, остеосаркомы |
Наследственная опухоль Вилмса | WT1 | Нефробластомы |
Применение новых противоопухолевых препаратов
Применение новых противоопухолевых препаратов, точечно воздействующих на молекулярные механизмы, лежащие в основе возникновения и развития опухоли, требует обязательной идентификации генетических нарушений, определяющих эффективность лекарственной терапии – создание своеобразного молекулярного портрета.
В настоящий момент выявлено большое количество клеточных мишеней, которые называются биомаркерами и используются в клинической практике для предсказания характера течения болезни и выбора оптимального мишень-направленного препарата каждому конкретному пациенту.
Такими биомаркерами являются: онкоген HER-2/neu при раке молочной железы, яичников, легкого; рецептор эпидермального фактора роста (EGFR) у пациентов с немелкоклеточным раком легкого, онкоген K-RAS при колоректальном раке, онкоген BRAF у пациентов с меланомой и др.
В онкологическом отделении (генетики) проводится анализ молекулярного профиля опухолей различных локализаций с использованием методов ПЦР в режиме реального времени, секвенирования, фрагментного анализа, флуоресцентной in situ гибридизации (FISH).
В 2013 и 2014 г. получены Международные сертификаты на проведение KRAS- и NRAS-тестирования методом секвенирования.
Генетический анализатор ABI 3130 («Applied Biosystems», США)
Методы лабораторной диагностики инфекционных заболеваний
Лаборатория располагает арсеналом методов, однако только 5 из них наиболее широко распространены:
Культуральный метод (метод посева)
Выявляет чистую культуру возбудителя. Метод сводится к тому, что полученный материал (мазок со слизистой оболочки, кровь, гной, кал и т.д) высевается на питательные среды. Среды могут содержать различные компоненты. Но суть сводится к следующему: микроорганизмы должны дать рост и колонии. Если есть рост патогенных микроорганизмов, то определяется их чувствительность к лекарствам: антибиотикам и бактериофагам.
Серологический метод (метод антител к возбудителю)
Тоже позволяет поставить диагноз. Метод основан на обнаружении в крови антигенов возбудителя или антител — специальных белков, которые образуются в организме в ответ на присутствие и размножение болезнетворных микроорганизмов. Антитела образуются постепенно, поэтому в крови их можно обнаружить только к концу первой недели инфицирования. Это главный недостаток метода.
Молекулярно-биологический метод (метод полимеразной цепной реакции (ПЦР), метод амплификации РНК (NASBA))
Определяет генетический материал возбудителя — ДНК или РНК в образцах (соскоб со слизистой, кровь, моча, кал и т.д). Чтобы уловить малые концентрации ДНК или РНК, необходимо увеличить количество копий. Для этого исследуемый образец помещают в прибор — амплификатор, который позволяет увеличить число копий ДНК в геометрической прогрессии. Для этого метода диагностики крайне важен правильный забор биоматериала.
Микроскопический метод (исследование под микроскопом)
Подразумевает приготовление препаратов на стекле. Материал: кровь, отделяемое слизистых оболочек и т.д. Стекла могут быть окрашенными или неокрашенными, в зависимости от типа инфекции. Врач исследует препарат под микроскопом и выдает результат на основании визуальной оценки: размер, форма, отношение к красителям и т.д.
Метод газовой хроматографии (ГХ-МС)
Выявляет возбудителей по продуктам их жизнедеятельности. Материал: кровь, моча, кал, отделяемое ран, слизистых оболочек.